MUCEM'in ortaya çıkışı, 2013 Avrupa Kültür Başkenti olarak hizmet veren Marsilya'da yılın ana ama tek olayı değil: Buna ek olarak, Stefano Boeri Kültür Merkezi ve Norman Foster Pavyonu Eski Liman'da göründü. Ancak MUCEM, 2000 yılında tasarlanmış, çok daha büyük bir girişimdir. Bu, belki de, tarih ve kültür zenginliği açısından benzersiz bir bölge olan, bir bütün olarak Akdeniz'e adanmış dünyadaki ilk müzedir.
Mimarın planına göre eski iskele J4 üzerinde bulunan müze, ufuk çizgisine ve ötesindeki Afrika'ya bakmakta ve böylece Akdeniz'in iki kıyısını birleştirmektedir.
Bina, içinde iki kat sergi galerisi ve 325 kişilik bir konferans salonunun bulunduğu 52 m'lik bir kenarı olan, içinde başka bir meydanın gizlendiği 72 m'lik bir cepheye sahip bir kare. Cephe ile binanın "çekirdeği" arasındaki boşlukta, ziyaretçilerin inceleme sırasında tırmandıkları merdivenler var. Sonuç olarak, kendilerini çatıda buluyorlar, 115 m uzunluğundaki yaya köprüsünden (77 m açıklıklı) müzenin ikinci bölümünün bulunduğu Fort Saint-Jean'a geçecekler. Köprü, açıklık cephesi ve binanın cam prizmasını örten çatı, ağaç benzeri yapısal destekler - hepsi ağır hizmet tipi fiber takviyeli betondan yapılmıştır.
Binanın toplam alanı 15.000 m2 olup, bunun 3.600 m2'si sergi salonlarıdır (3-5 yılda bir değiştirilen kalıcı bir sergi ve geçici sergiler olacaktır). Yeni binanın bütçesi, fuarın tasarımı da dahil olmak üzere 113,4 milyon euro olarak gerçekleşti ve aynı zamanda Fort Saint-Jean ve şehirdeki restorasyon ve arşiv merkezinden oluşan MUCEM'e toplam 191 milyon euro harcandı.
