Bu sipariş 1998 yılında Japon mimar Arata Isozaki tarafından geri alındı. Giorgio Vasari tarafından tasarlanan 16. yüzyıl sarayının tam aksine, müze binasının doğusundaki küçük Piazza del Grano meydanının tamamını kaplayacak bir çelik ve taş salon inşa etmeyi önerdi.
Isozaki'nin önerisinin yayınlanmasından 6 yıl sonra, İtalya'da uygulamanın fizibilitesi, gelenekleri korumanın önemi ve Floransalı yetkililerin yeni binalar inşa etme yeteneği, yüksek kaliteli modern mimari örnekleri hakkında ateşli tartışmalar yapıldı.
Geçtiğimiz yıl Piazza Grano'da başlayan kazılar, Palazzo Uffizi'den önceki ortaçağ binalarının kalıntılarını ortaya çıkardı. Bakan Urbani, orada çalışan arkeologlara göre buluntuların inşaatı aksatmaması gerektiğine rağmen, iptal kararında belirleyici bir rol oynadıklarını söyledi. Isozaki'nin şimdi projesini bu yılın Haziran ayına kadar antik yapı kalıntılarını da içerecek şekilde revize etmesi gerekiyor. Projenin birçok destekçisi, ana nedenlerin kültürel değil siyasi olduğundan şüphelendiğinden, mimarın planının tüm koşulları yerine getirse bile uygulanıp uygulanmayacağı belirsizliğini koruyor.
