Önde gelen Hintli modernist mimarlar Charles Correa ve Fumihiko Maki tasarıma dahil oldu. İlki, inşaatı bu yıl başlayacak olan İsmaili Merkezi binasının sahibine ait. Maki ayrıca Ağa Han Müzesi için Ağa Han'ın kendi koleksiyonundan İslam sanatı eserlerini sergileyecek bir proje geliştirdi (daha önce bu enstitünün Londra'da açılması planlanmıştı, ancak bu planlar başarısız oldu); uygulaması 2009 yılında başlamalıdır.
Her iki bina da, müşteri tarafından tasarlandığı şekliyle, geleneksel İslam mimarisinden esinlenmelidir, ancak aynı zamanda, neo-modernizm biçiminde modern binalar olarak kaldıkları zaman ve kökenlerine ait olacaklar. Toronto'nun eteklerinde toplam yaklaşık 7 hektarlık yeni Winford Park'ta yer alacaklar. Peyzaj tasarımı, Beyrut'taki Samir Kassir Meydanı peyzaj projesi için 2007 Ağa Han Ödülü sahibi Beyrut mimarı Vladimir Djurovic'e aittir. Parkı geleneksel Arap dört bahçe planının bir varyasyonu olarak tasavvur etti; Kompleksi ayrıca gürültüsü topluluğun yanından geçen otoyolun gürültüsünü bastırmak için tasarlanmış beş havuz ve şelaleyi de içerecek.
Correa'nın İsmaili merkezi kireçtaşı ile karşı karşıya kalacak; bunun bir parçası olan jamoatkhana (dua evi), girift bir şekle sahip bir cam kubbe ile kaplanacaktır. Şu anda tamamlanma aşamasında olan müzenin projesinde bir de kubbe; avlu, binanın planında merkezi bir yer kaplayacak ve dış duvarları, kompozisyona dinamizm kazandıracak şekilde hafifçe dışa eğik olacak. Binada kalıcı sergi salonları, geçici sergi galerileri ve 350 koltuklu bir oditoryum düzenlenecek.
Ağa Han projesinin toplam bütçesi 200 milyon doları aşıyor. Correa binası 2010 sonunda, müze ise bir yıl sonra tamamlanacak.
